MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-107

Total Repeats: 2678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020393	T	7	7	132	138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020393	CTTT	2	8	148	155	0 %	75 %	0 %	25 %	452202696
3	NC_020393	ACA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202696
4	NC_020393	ATA	2	6	192	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202696
5	NC_020393	TCT	2	6	211	216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202696
6	NC_020393	TAG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202696
7	NC_020393	TTA	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202696
8	NC_020393	GAT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202696
9	NC_020393	ATC	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202696
10	NC_020393	GAA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020393	ATG	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020393	AGC	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020393	TCA	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020393	CT	3	6	686	691	0 %	50 %	0 %	50 %	452202697
15	NC_020393	TCG	3	9	787	795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202697
16	NC_020393	AGT	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202697
17	NC_020393	CAGT	2	8	897	904	25 %	25 %	25 %	25 %	452202697
18	NC_020393	TTA	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202697
19	NC_020393	TCT	2	6	999	1004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202697
20	NC_020393	GAA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202697
21	NC_020393	TCGGT	2	10	1039	1048	0 %	40 %	40 %	20 %	452202697
22	NC_020393	TCT	2	6	1113	1118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202697
23	NC_020393	GTC	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202697
24	NC_020393	TCG	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202697
25	NC_020393	AAT	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202697
26	NC_020393	TGT	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202697
27	NC_020393	ATT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202697
28	NC_020393	CGT	2	6	1526	1531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202697
29	NC_020393	TAC	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202697
30	NC_020393	TGGT	2	8	1723	1730	0 %	50 %	50 %	0 %	452202697
31	NC_020393	TTC	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202697
32	NC_020393	CCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020393	TCC	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020393	TGC	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020393	TAC	2	6	2071	2076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020393	TTC	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020393	TC	3	6	2198	2203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020393	CGC	2	6	2209	2214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_020393	CCG	2	6	2222	2227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020393	TTG	2	6	2265	2270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020393	GGAGT	2	10	2436	2445	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020393	AT	3	6	2573	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	452202698
43	NC_020393	T	6	6	2626	2631	0 %	100 %	0 %	0 %	452202698
44	NC_020393	CTC	2	6	2674	2679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202698
45	NC_020393	TA	4	8	2800	2807	50 %	50 %	0 %	0 %	452202698
46	NC_020393	GTTTT	2	10	2826	2835	0 %	80 %	20 %	0 %	452202698
47	NC_020393	TA	3	6	2862	2867	50 %	50 %	0 %	0 %	452202698
48	NC_020393	ATAA	2	8	2892	2899	75 %	25 %	0 %	0 %	452202698
49	NC_020393	CAA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202698
50	NC_020393	TCC	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202698
51	NC_020393	GAA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202698
52	NC_020393	GTA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202698
53	NC_020393	AAG	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202698
54	NC_020393	TAA	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202698
55	NC_020393	AG	3	6	3362	3367	50 %	0 %	50 %	0 %	452202698
56	NC_020393	GTA	2	6	3368	3373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202698
57	NC_020393	TTG	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202698
58	NC_020393	AC	3	6	3395	3400	50 %	0 %	0 %	50 %	452202698
59	NC_020393	AT	3	6	3488	3493	50 %	50 %	0 %	0 %	452202698
60	NC_020393	ATTCAT	2	12	3535	3546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202698
61	NC_020393	A	6	6	3547	3552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020393	GATG	2	8	3629	3636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020393	TG	3	6	3635	3640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020393	AAG	2	6	3666	3671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020393	ATTA	2	8	3727	3734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020393	ATA	3	9	3751	3759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020393	ATATT	2	10	3765	3774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020393	TAC	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020393	TTC	2	6	3842	3847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020393	TAT	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020393	TAA	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020393	AAATA	2	10	4005	4014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020393	A	7	7	4051	4057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020393	A	7	7	4073	4079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020393	TTCT	2	8	4085	4092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020393	T	6	6	4117	4122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020393	TGA	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202699
78	NC_020393	T	6	6	4170	4175	0 %	100 %	0 %	0 %	452202699
79	NC_020393	AGTA	2	8	4231	4238	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
80	NC_020393	ACG	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202699
81	NC_020393	TCA	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202699
82	NC_020393	TAA	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202699
83	NC_020393	AGC	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202699
84	NC_020393	ACA	2	6	4398	4403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202699
85	NC_020393	ACT	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202699
86	NC_020393	TCT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202699
87	NC_020393	CGTATT	2	12	4480	4491	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202699
88	NC_020393	AGG	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202699
89	NC_020393	TTCATA	2	12	4616	4627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202699
90	NC_020393	ACA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202699
91	NC_020393	TG	3	6	4667	4672	0 %	50 %	50 %	0 %	452202699
92	NC_020393	AT	3	6	4740	4745	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
93	NC_020393	CTA	2	6	4761	4766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202699
94	NC_020393	TC	3	6	4769	4774	0 %	50 %	0 %	50 %	452202699
95	NC_020393	AC	3	6	4787	4792	50 %	0 %	0 %	50 %	452202699
96	NC_020393	GTAT	2	8	4793	4800	25 %	50 %	25 %	0 %	452202699
97	NC_020393	A	7	7	4802	4808	100 %	0 %	0 %	0 %	452202699
98	NC_020393	ATT	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202699
99	NC_020393	GAA	2	6	4835	4840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202699
100	NC_020393	TA	3	6	4858	4863	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
101	NC_020393	AGAT	2	8	4865	4872	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
102	NC_020393	GAAT	2	8	4937	4944	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
103	NC_020393	AACAA	2	10	4980	4989	80 %	0 %	0 %	20 %	452202699
104	NC_020393	CAA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202699
105	NC_020393	A	7	7	5027	5033	100 %	0 %	0 %	0 %	452202699
106	NC_020393	GTA	2	6	5057	5062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202699
107	NC_020393	TA	3	6	5084	5089	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
108	NC_020393	TTTA	2	8	5166	5173	25 %	75 %	0 %	0 %	452202699
109	NC_020393	TCA	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202699
110	NC_020393	ATTG	2	8	5253	5260	25 %	50 %	25 %	0 %	452202699
111	NC_020393	TTC	2	6	5274	5279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202699
112	NC_020393	CTC	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202699
113	NC_020393	GAA	2	6	5313	5318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202699
114	NC_020393	A	6	6	5317	5322	100 %	0 %	0 %	0 %	452202699
115	NC_020393	AT	4	8	5347	5354	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
116	NC_020393	TCT	3	9	5370	5378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202699
117	NC_020393	TCT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202699
118	NC_020393	A	7	7	5479	5485	100 %	0 %	0 %	0 %	452202699
119	NC_020393	AT	3	6	5495	5500	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
120	NC_020393	A	6	6	5548	5553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020393	A	6	6	5616	5621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020393	A	6	6	5768	5773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020393	CT	3	6	5783	5788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020393	ACT	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020393	TAAT	2	8	5863	5870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020393	TTA	2	6	5873	5878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020393	GAT	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020393	TTC	2	6	5903	5908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
129	NC_020393	GAG	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202700
130	NC_020393	TTCC	2	8	5944	5951	0 %	50 %	0 %	50 %	452202700
131	NC_020393	TGG	2	6	6029	6034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202700
132	NC_020393	TCT	2	6	6074	6079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
133	NC_020393	TCT	2	6	6096	6101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
134	NC_020393	GTA	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
135	NC_020393	CTT	2	6	6259	6264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
136	NC_020393	GAT	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
137	NC_020393	TGT	2	6	6450	6455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202700
138	NC_020393	ATT	2	6	6494	6499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202700
139	NC_020393	TTC	2	6	6569	6574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
140	NC_020393	CTT	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
141	NC_020393	TA	3	6	6745	6750	50 %	50 %	0 %	0 %	452202700
142	NC_020393	TC	3	6	6786	6791	0 %	50 %	0 %	50 %	452202700
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259	NC_020393	TTAC	2	8	12959	12966	25 %	50 %	0 %	25 %	452202703
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269	NC_020393	TGTA	2	8	13296	13303	25 %	50 %	25 %	0 %	452202704
270	NC_020393	CCG	2	6	13317	13322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202704
271	NC_020393	ACA	2	6	13530	13535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202704
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408	NC_020393	T	6	6	19265	19270	0 %	100 %	0 %	0 %	452202714
409	NC_020393	CCT	2	6	19492	19497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202715
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413	NC_020393	TAAT	2	8	19638	19645	50 %	50 %	0 %	0 %	452202715
414	NC_020393	AT	3	6	19688	19693	50 %	50 %	0 %	0 %	452202715
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442	NC_020393	AT	3	6	20791	20796	50 %	50 %	0 %	0 %	452202716
443	NC_020393	CTA	2	6	20804	20809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202716
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451	NC_020393	ATA	2	6	21075	21080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202716
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453	NC_020393	ATA	2	6	21143	21148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202716
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